Berdasarkan visi yang telah dirumuskan maka misi SMA Negeri Bonjol dalam waktu satu ( 1 ) tahun kedepan adalah:

1. Melaksanakan pembelajaran dengan berbagai strategi / model dan pemanfaatan multimedia.
2. Melaksanakan pembinaan bidang sains, seni dan olah raga prestasi.
3. Melaksanakan pendidikan karakter melalui pembiasaan dan terintegrasi.
4. Meningkatkan kegiatan ekstrakurikuler melalui kerjasama dengan pihak terkait.
5. Meningkatkan mutu Pendidik dan Tenaga kependidikan.
6. Melengkapi sarana dan prasarana, menumbuhkan budaya peduli lingkungan.
7. Menerapkan pengelolaan sekolah yang mengacu pada Standar Manajemen Mutu dengan melibatkan seluruh warga sekolah.
8. Meningkatkan berbagai kegiatan keagamaan/religious.
9. Meningkatkan berbagai kegiatan yang berbasis budaya minang kabau dan pendidikan alquran.
10. Melaksanakan program kerjasama dan kemitraan dengan masyarakat, alumni, intitusi pendidikan, dan aparat pemerintahan.